La limpieza del intercambiador entálpico se realiza en unos sencillos pasos:

1. Primero, aspire el intercambiador con una aspiradora con cepillo suave.
2. Luego enjuáguelo con agua limpia (máx. 50 °C).
3. No utilice aire comprimido ni limpiadoras de alta presión.
4. Después del enjuague, deje que el agua se drene por completo.
5. La humedad restante se puede eliminar con un secador – solo aire frío.
6. Una vez completamente seco, vuelva a colocarlo en la misma orientación.

No se recomiendan productos químicos de limpieza. Solo en caso de necesidad de desinfección del intercambiador, se puede utilizar una solución débil de ácido peracético (CH₃CO₃H) con una concentración del 0,1–0,2 %, que debe enjuagarse cuidadosamente con agua limpia.