Održavanje entalpijskog izmjenjivača nije zahtjevnije od klasičnog. Upute su opisane u priručniku i našem video vodiču. Ukratko: najprije usisajte izmjenjivač usisavačem s mekanim nastavkom, zatim ga isperite čistom vodom (max. 50 °C). Nikada ne koristite komprimirani zrak niti visokotlačni perač.

Nakon ispiranja ostavite da voda potpuno iscuri. Preostalu vlagu možete pažljivo ukloniti sušilom za kosu, ali samo hladnim zrakom. Kada je potpuno suh, vratite izmjenjivač u istom položaju.

Kemijska sredstva se ne preporučuju. Samo u slučaju dezinfekcije može se koristiti slaba otopina peroctene kiseline (0,1–0,2 %), uz temeljito ispiranje.