Protože entalpický výměník přenáší i vlhkost, mohlo by se zdát, že riziko vzniku plísní je vyšší. Ve skutečnosti však veškerá vlhkost odchází pryč spolu s čerstvým vzduchem, takže riziko vzniku plísní nehrozí.

Naše doporučení je v zimních měsících jednotku nikdy nevypínat, aby byl odvod vlhkosti zajištěn nepřetržitě. Pokud byste přesto potřebovali jednotku odstavit, vyjměte výměník, propláchněte jej čistou vodou, důkladně vysušte a teprve poté jej vraťte zpět.